El 20 de septiembre de 2021, Larios Sánchez fue detenido por ocho oficiales de la policía, quienes ingresaron con violencia por diferentes partes de su vivienda, allanando el inmueble sin orden judicial. Fue trasladado hacia las celdas de la Dirección de Auxilio Judicial conocidas como “El Nuevo Chipote”. Sin embargo, su paradero fue conocido por sus familiares hasta el 13 de octubre de 2021. El 24 de septiembre del 2021, también fue allanada la casa de habitación de Raity Larios, hija del Larios, como parte del proceso investigativo contra su padre, la que permaneció asediada por oficiales de la policía, vestidos de civil. Hasta el 22 de enero de 2022 se dictó prisión preventiva por un periodo de 90 días, sin tener acceso a una debida defensa. El 28 de febrero de 2022 fue declarado culpable por los delitos de “conspirar para cometer menoscabo contra la integridad nacional” y “propagación de noticias falsas” imponiéndosele una condena de 13 años de prisión.

En marzo 2022, se enfermó de COVID19 donde no recibió la atención médica adecuada ni especializada. Durante su estancia en la cárcel recibió escasas raciones de comida y de mala calidad, no se le permitía patio sol, permaneció en celdas de castigo por más de cinco meses, la cual era totalmente hermética, sellada, que medía 2 x 2 mtrs. con una pequeña ventanilla por donde pasaban los alimentos y entraba un poco de aire, la luz eléctrica permanecía encendida 24 horas, dormía en una loseta de cemento sobre una colchoneta delgada y en mal estado, sin contar con frazadas ni sábanas para protegerse del frío por las noches, situación que agravó su estado de salud.

En los primeros meses hasta que fue condenado fue llevado a interrogatorios a diario por agentes policiales.